Pour cette troisième étape, une épreuve particulière : un contre-la-montre par équipe de 35,5 km autour de la ville de Cholet. En 2015, l'équipe BMC avait remporté l'épreuve entre Vannes et Plumelec devant l'équipe Sky. Cette année, les deux formations devraient encore être favorites à la victoire, menées par Chris Froome pour la Sky et Richie Porte pour la BMC. Sur un parcours à priori sans grande difficulté, ce sera la première occasion de faire des écarts entre les favoris de ce Tour de France.
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